La dynamique luthéro-réformée a rassemblé aussi bien en Alsace qu’en Moselle que dans le reste de la France, les luthériens et les réformés au sein de l’Union des Eglises Protestantes d’Alsace et de Lorraine et de l’Eglise Protestante Unie de France (EPUdF). C’est le pilier le plus connu qui représente plus de la moitié des protestants en France aujourd’hui. L’autre pilier est constitué par les églises évangéliques qui, fort diverses insistent sur l’orthodoxie biblique, l’évangélisation et l’orthopraxie comportementale en matière, tout particulièrement, d’éthique sexuelle et familiales. Ces deux grands pôles sont présents au sein de la Fédération Protestante de France (FPF) qui a été créée en 1905 pour représenter le protestantisme et, si besoin est, défendre ses intérêts auprès des pouvoirs publics. Elle rassemble aujourd’hui des Eglises de différentes sensibilités (luthéro-réformées, baptistes, adventistes, évangéliques, pentecôtistes, africaines, la Mission évangélique tzigane, l’Armée du Salut,…). Fédérant une grande diversité d’Eglises et d’orientation théologiques et éthiques, le lien fédératif est régulièrement traversé de tensions — par exemple après la décision prise par l’EPUdF en 2015 d’autoriser les pasteurs qui le souhaitaient à bénir des couples de même sexe — mais cette unité dans la diversité est structurelle dans le protestantisme. La FPF comporte un certain nombre de services communs dans le domaine des aumôneries (militaire, pénitentiaire, hospitalière), dans le domaine des médias et pour tout ce qui concerne les relations avec d’autres Eglises (œcuménisme) et d’autres religions. En 2010 a été créée le Conseil National des Evangéliques de France (CNEF) qui a voulu rassembler les diverses sensibilités évangéliques et mieux assurer la connaissance et la reconnaissance de ce protestantisme évangélique tant au sein du monde protestant lui-même que dans la société en général (avec par exemple le souci d’être connu des pouvoirs publics à l’échelle nationale et départementale). Le CNEF a permis de réconcilier les courants orthodoxes-piétistes et pentecôtistes-charismatiques qui divisaient profondément le monde protestant évangélique.